1970年代，政府預定在蘇澳鎮港邊里設立火力發電廠，因火電廠屬重污染工業，受到當時宜蘭縣政府和當地居民及環保人士的反對，經過多年的抗爭行動，在1993年8月24日，宜蘭縣政府根據野生動物保育法，劃設本區並公告為「宜蘭縣無尾港水鳥保護區」。每年10月至翌年3月，是冬候鳥來蘭陽平原度冬及過境的季節，同時也是來港口社區賞鳥的最佳時機。 根據宜蘭縣野鳥學會及無尾港文教促進會的調查紀錄，保護區每年約會出現36科170種鳥類以上，主要以雁鴨科水鳥為主，其中以小水鴨數量最多，其次是花嘴鴨、綠頭鴨、瑟嘴鴨、尖尾鴨、白眉鴨等，最大量時約有2300隻左右。