港口庄扼大港(無尾港)之門戶，不論從哪一個年代來看，都位居水系戰略上的重要位置。綜合新馬地區耆老的說法，在未形成武荖溪之前的畚箕湖時代，部分水源從湖口(新城與隘丁交界)流出，沿七星山匯集於三面城前，再匯流隘丁下埤仔圳、功勞埔港水，在港口庄東方形成大港，向東南流到澳仔角出海。 形成武荖溪後，溪水穿過功勞埔、大坑罟間，與功勞埔港、下埤仔圳在過港仔會合，過港口庄流至澳仔角出海。在1967年農曆10月間，連續12天的豪雨導致武荖溪堤防南岸(現國道蘇澳收費站附近)潰堤，引發土石流造成地貌改變而形成新城溪。之後的土地重劃設置港口大排，連結無尾港水系。